علم الأحياء الدقيقة الطبي^[1] يعدّ فرع من فروع الطب والأحياء الدقيقة التي تتعامل مع الأحياء الدقيقة والتي تتضمن البكتيريا والفيروسات والطفيليات والفطريات التي تكون مهمة طبياً ولها القدرة على احداث الأمراض في الكائن البشري.